病原宏基因組二代測序是什么？
病原宏基因組二代測序（mNGS） ，是不基于培養(yǎng)，直接從環(huán)境/臨床樣品中提取全部微生物的DNA，利用基因組學(xué)的研究策略研究環(huán)境樣品中所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落功能，可廣泛分析臨床樣本微生物組（細(xì)菌、真菌、病毒）的高通量測序方法。. 分析流程.
淺宏基因組測序方案是什么？
淺宏基因組測序方案是去年knights-lab在msystems上發(fā)表的針對16s分辨率和宏基因組高成本之間的一個 折中方案 ，通過 降低測序深度 ，每個樣本 50萬 reads，但是物種的分辨率 并沒有低于 一般宏基因組（普遍5~10G數(shù)據(jù)量）。
病原宏基因組二代測序(mngs)是什么？
病原宏基因組二代測序（mNGS） ，是不基于培養(yǎng)，直接從環(huán)境/臨床樣品中提取全部微生物的DNA，利用基因組學(xué)的研究策略研究環(huán)境樣品中所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落功能，可廣泛分析臨床樣本微生物組（細(xì)菌、真菌、病毒）的高通量測序方法。 1.面對血液、痰液、腦脊液、組織、拭子等紛紛雜雜的標(biāo)本類型，如何建立統(tǒng)一的核酸提取標(biāo)準(zhǔn)使得病原體的檢測效能最大化困難重重。
什么是宏基因組學(xué)？
宏基因組學(xué)（Metagenomics）以微生物生態(tài)群落中所有微生物的基因組為研究對象，通過研究群落中物種組成和功能組成、同一個群體內(nèi)不 同微 生物的相互作用、微生物群落與宿主之間的相互作用，并進行不同表型的樣品比較、分析，來解釋生物學(xué) 現(xiàn)象。 近年來，NGS 技術(shù)越來越廣泛地被應(yīng)用于腸道微生物領(lǐng)域的宏基因組學(xué)研究。